理工大學醫療科技及資訊學系副教授蕭傑恒——冀政府成立病毒基因排序工作小組 加強病毒追蹤
＊標題由編輯所加
各位理大醫療化驗學系的同學：
轉眼間，這個學期已經來到第十一週。再過兩星期，你們就要應付實驗課的考試，我相信你們已經在埋頭苦幹的作準備。
在疫情期間，大學採用網上教學。沒有學生的校園缺少了以往的活力和生氣。我們已有一年多的時間，無法在課堂上見面。有同學笑言，只能在電視、報紙上才會見到我。又有同學問我，為何會參與新冠病毒的基因排序工作？
我是個註冊醫務化驗師，是香港醫療體系的一份子。在疫情爆發初期，眼見前線的醫護，和醫院實驗室的同行疲於奔命，而自己卻安坐在大學的辦公室。那種無能為力的不安，驅使我鼓起勇氣，冒昧地聯絡各醫院，提出合作。多得各微生物科醫生的信任，提供確診者的病毒樣本，讓我們進行基因排序分析。結果，我們發現當時在港島東的隱形傳播鏈，亦揭示佛堂群組超級傳播個案的病毒源頭。自始之後，我和我的研究團隊一直透過病毒全基因組排序，監測新冠病毒在我們社區的傳播鏈，找尋病毒傳播源頭。我們的研究結果成功協助政府在第三、四波疫情，堵塞海員免檢安排和旅客在隔離酒店接受探訪等防疫漏洞。
踏入2021年，多間公立醫院相繼爆發小規模疫情。我們針對這連串感染個案進行基因排序分析，協助院方追蹤傳播鏈。差不多同一時間，外國出現變種病毒。在醫管局協助下，團隊為輸入個案進行基因分析，以監測變種病毒流入香港的情況。要數最有成功感的，是在今年四月，一名印度裔男子完成檢疫後確診，之後陸續有外傭感染個案，最終我們發現，該確診男子與東涌映灣園外傭的病毒基因完全相同，促使衛生防護中心進一步追問他們行蹤，揪出整條病毒傳播鏈和當中的密切接觸者，成功阻截該變種病毒於社區進一步擴散。
第四波疫情完結至今，我們仍然無間斷為輸入個案做基因排序。用意是如果社區再出現本地源頭不明個案，我們就可以迅速地作基因比對，找尋病毒的來源，推測感染的途徑。最近，我們又建立了一個病毒基因地理資訊系統，將個案的病毒基因，確診時間，再加上患者的行蹤，以互動地圖的方式表示出來。舉例說，若果社區在幾日內出現兩個或以上個案，而他們的病毒基因是相同的話，患者的住所和到訪過的地方，會以同一種顏色點在地圖上標示。系統又會根據個案確診的時間，以動畫方式將顏色點按次序顯示出來，再以虛線把這些地點串連，模擬該病毒株在社區的傳播路徑。我相信這個系統可以幫助個案追蹤，令圍封檢測等防疫措施更精準地實施，為我們日後通關，締造有利條件。
做基因排序要有兩個元素，才可以有效阻截病毒傳播。第一，要做得夠快。如果要等四五日才完成，以新冠病毒的傳播速度，恐怕病毒已開始在社區傳開去，分析的結果只能作「歷史回顧」。故此，我們不斷改善技術，令基因排序可以在10小時內完成。
第二，要做得夠多。在第四波疫情時期間，有很多本地源頭不明個案沒有進行基因排序，令疫情好像未完成的砌圖一樣，根本看不清真正的圖像。其實除了理大，其他大學的研究團隊亦有做病毒基因排序。我相信假如結合各團隊之力，絕對可以分析所有個案。只是我們之間未有溝通機制，不同團隊不時重複分析相同個案，實在浪費了大家的資源。我很希望，政府能牽頭，成立病毒基因排序工作小組，將個案按地區分派予不同團隊，讓我們分工合作，以增加處理量和速度，協助衛生防護中心建立病毒監測網，以應付可能出現的新一波疫情。
各位同學，醫療科技日新月異，你們可能會對基因排序等新技術有興趣，我們學系不論在本科或碩士課程，都新增了多個關於分子診斷和生物信息學的科目，希望你們在畢業後能學以致用，提升香港醫務化驗師的技術水平。
雖然細菌、病毒不停地演變，但其實人類亦不斷進化。在理大任教的八年期間，我深刻體會到這一代的大學生，不論是領悟力和分析力，都比十多年前的我強得多。作為老師，我有責任將知傾囊相授。我相信你們將來一定可以令香港的醫療科技更上一層樓。你們加油，努力溫習，我們試場上見！
Gilman
2021年11月6日
【聲音完全版】
香港電台第一台FM92.6 - 94.4星期六早上九點至九點二十分
主持：陳顥之、張鳳萍
編導：陳顥之、張鳳萍
監製：林嘉瑜
學者、議員、官員及社會人士透過書信形式，分析社會現象，細訴個人感受。
